然而并非所有完成了疫苗接种的人都能获得受欧盟认可的疫苗护照。
欧洲药品管理局（EMA）是欧盟负责药品评估和监督的机构，迄今为止仅批准了四种新冠病毒疫苗，它们是：辉瑞、莫德纳、阿斯利康、强生。
各成员国政府可自行决定是否接受尚未批准的疫苗。尽管他们可以自由接受尚未获得 EMA 批准的疫苗，但大多数欧盟和申根地区成员国已经决定不这样做。
例如，法国对于完成疫苗接种的定义：
接种辉瑞、莫德纳或阿斯利康疫苗的第二剂已超过两周；
接种强生疫苗一剂已超过一周；
在已感染过新冠且康复的前提下接种以上四种任何疫苗一剂已超过两周。
冰岛与法国明确表示仅接受 EMA 批准的疫苗，立陶宛明确表示拒绝俄罗斯的卫星V疫苗。
希腊表示将认可俄罗斯的卫星V疫苗，斯洛文尼亚除了认可卫星V以外，还认可中国的国药与科兴疫苗。匈牙利不仅认可并采购了俄罗斯卫星V与国药，还认可中国的康希诺疫苗（但随后取消了采购订单）。
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